Το 2ο ΓΕΛ Πολίχνης στεγάζεται σε κτίριο που διαθέτει:  

1.  Στο ισόγειο 4 αίθουσες διδασκαλίας, εργαστήριο φυσικών επιστημών, κυλικείο, αποθηκευτικούς χώρους και τουαλέτες.

2. Στον 1ο όροφο υπάρχουν 5 αίθουσες διδασκαλίας, εργαστήριο πληροφορικής, γραφεία και πλούσια δανειστική βιβλιοθήκη. Υπάρχει επίσης και ένας χώρος συγκέντρωσης που μπορεί να λειτουργήσει ως αναγνωστήριο. Οι αίθουσες είναι εξοπλισμένες με πτυσσόμενες οθόνες προβολής, ενώ υπάρχει ασύρματη σύνδεση wifi και δυνατότητα χρησης φορητών υπολογιστών. 

Η αυλή είναι μεγάλη για τις ανάγκες των μαθητών και διαθέτει παγκάκια αλλά όχι κάποιο στεγασμένο χώρο. Υπάρχει γήπεδο μπάσκετ και δυνατότητα υποδοχής φιλέ για βόλευ. Το κτίριο διαθέτει ράμπα για άτομα με κινητικά προβλήματα.